Calendario Lezioni

Master 2019-2021 in "Genomic Data Science"

Il Master si articola in 10 moduli divisi in 5 moduli annui (A-E), con una frequenza obbligatoria non inferiore al 75%. Le lezioni frontali si tengono una settimana al mese dal lunedì al venerdì indicativamente dalle ore 9.30 alle 12.30 e dalle 14.30 alle 17.00, da febbraio a ottobre, presso l’Aula informatizzata della Cascina Cravino, Via Agostino Bassi 21, Pavia, secondo il seguente calendario:

Calendario primo anno

Prima settimana
Statistica con R
(Prof. Gentilini)
17-21 febbraio 2020
1) L’ambiente di programmazione R
2) Data import e data mining con R
3) Visualizzazione grafica dei dati con R
4) Inferenza statistica con R
Seconda settimana
Modelli di regressione
(Prof. Comelli)
18-22 maggio 2020
1) Regressione lineare
2) Regressione logistica
3) Modelli lineari misti
4) Analisi di sopravvivenza
Terza settimana
Metodi di ricampionamento
(Prof. Grassi)
spostato a settembre, data da definire
1) Permutazione e randomizzazione
2) Simulazione Monte Carlo
3) Ricampionamento e bootstrap
4) P-values empirici e FDR
Quarta settimana
Epidemiologia genetica
(Prof. Bernardinelli + Gentilini)
8-12 giugno 2020
1) Disegno di studi sperimentale e studi osservazionali
2) Disegno ed analisi di studi di linkage parametrico e non parametrico
3) Disegno ed analisi di studi di associazione familiare
4) Disegno ed analisi di studi di associazione di popolazione
Quinta settimana
Statistica genetica
(Prof. Bernardinelli + Gentilini)
4 – 9 ottobre 2020
1) Disegno e analisi genome-wide(GW)
2) Pre-processing, controllo di qualità, imputazione e analisi statistica GW
3) Analisi GW di dati di metilazione
4) Analisi GW di dati di espressione

Calendario secondo anno

Prima settimana
Gestione e analisi dei BIG DATA
(Prof. Luigi Corsaro)
22-26 febbraio 2021
Seconda settimana
Bioinformatica applicata alla genetica
(Prof. Davide Gentilini)
8-12 marzo 2021
Terza settimana
Statistica Genomica
()
12-16 aprile 2021
Quarta settimana
POST-GWAS
(Prof.ssa Luisa Bernardinelli e Prof. Davide Gentilini)
3-7 maggio 2021
Quinta settimana
Machine Learning
()
8-15 settembre 2021

Seguirà il tirocinio (2000 ore in due anni), il quale, previo accordo con i coordinatori del Master, potrà essere svolto per il monte ore complessivo anche in un unico periodo.

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    Universita di Pavia. Dipartimento di Scienze del Sistema Nervoso e del Comportamento
    Coordinatore
    Prof.ssa Luisa Bernardinelli
    Universita di Pavia. Dipartimento di Scienze del Sistema Nervoso e del Comportamento
    Coordinatore Vicario
    Prof. Mario Grassi
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